香港中文大学（深圳）金融工程硕士项目旨在向学生提供全面的金融理论知识，特别是定量分析方法在金融中的应用。此项目为全英文授课 (“中国金融市场概论”例外)。学习年限一般为两年，包括秋季、 春季以及夏季（短）三个学期。如提前满足毕业要求（修满30学分），也可申请一年毕业。另最长 修业时间为三年。本项目为立志投身于证券，银行，金融管理，管理与策略咨询，定量分析等行业的人员设立，致力于帮助学生掌握金融理论，定量分析方法以及程序设计技术，使之在面临迅速发展的 中国以及国际金融市场所带来的挑战时，能够发挥所学，服务企业与社会。金融工程硕士毕业生每年的就业率都超过95%。 毕业生们现在就职的公司包括但不限于中国国际金融有限公司，中信集团， 摩根士丹利华鑫证券，汇丰银行，中国工商银行和火币网。

数据科学理学硕士项目由香港中文大学（深圳）数据科学学院与经管学院共同开设，并与深圳市大数据研究院和深圳高等金融研究院合作。项目旨在使学生掌握大数据及商业分析方面的基础理论知识和专业技能，接触到支撑大数据技术的前沿理论与方法，并能在商业、政府、安全、医疗、生物、自然科学、环境等领域中充分利用所学知识解决与大数据采集、管理及分析相关的问题。课程采用全英文教学，学制24个月（待定）。学生也可以在就读期间参与到业界实习、实验室科研、海外交换，亦或修读更多课程，从而将学制延长至最多36个月。两所学院及研究院的优秀师资将共同担任项目授课教师。