硕士研究生
数据科学理学硕士项目由香港中文大学（深圳）数据科学学院与经管学院共同开设，并与深圳市大数据研究院和深圳高等金融研究院合作，来自两所学院及研究院的优秀师资也将共同担任项目授课教师。数据科学理学硕士项目学制2年，毕业生将习得最尖端的大数据处理技术，并接触到支撑大数据技术的前沿理论与方法。 此外，学生将在毕业前参与一个实际研究课题项目来展示他们在商业、政府、安全、医疗、生物、自然科学、环境等领域中能够熟练运用数据科学的基本概念来设计创新的方法及应用。
香港中文大学（深圳）与香港中文大学于2015年合作开办金融工程理学硕士项目。该项目是香港中文大学(深圳)设立的首批硕士课程之一。学生一旦达到毕业要求，将获发香港中文大学之硕士学位。该项目致力于帮助学生掌握金融理论，定量分析方法以及程序设计技术，使之在面临迅速发展的中国以及国际金融市场所带来的挑战时，能够发挥所学，服务企业与社会。该项目要求学生在两学年（含三个学期：秋季、春季、夏季）中修满30学分课程。课程设置旨在帮助学生学习掌握定量分析方法以及这些方法在建模分析金融市场和金融工具中的应用。
生物信息学硕士专业是一项跨领域的学科，由香港中文大学（深圳）医学院和数据科学学院共同开设，涵括生命科学、计算科学与数据科学、物理、化学、统计等基础学科知识。近年来，生物信息学已成为现代生物医学研究不可或缺的关键支点，从生物大数据中挖掘新颖的生物标志物与分子调控机制，进而研制出疾病诊断与治疗的方案，在生物技术及生物制药行业中的权重日益增长。在国家与企业的大力支持下，粤港澳大湾区的生物医药产业正快速增长，其中新药开发、检测试剂研发、医学临床应用更是知识密集产业。本项目将进一步借助香港中文大学（深圳）医学学科群、生命科学、数据科学等方面发展优势，培养市场紧缺的且具有生命科学与新药开发专业知识的跨学科人才。
人工智能与机器人理学硕士项目是由香港中文大学（深圳）数据科学学院和理工学院共同开设。学制为两年，并提供两个细分方向供学生选择：人工智能和机器人。本项目依托港中大（深圳）数据科学学院、理工学院及深圳市人工智能与机器人研究院的优秀师资和科研力量，旨在培养人工智能与机器人领域的尖端人才。学生将掌握计算机科学、人工智能和机器人领域的基本理论，并在机器学习、计算机视觉、自然语言处理、机器人、自动化、智能系统和人机交互等领域深入学习。
